ขั้นตอนการออกแบบ นับเป็นหัวใจสำคัญในการพัฒนาแอปพลิเคชัน  แอปพลิเคชันที่พร้อมนำไปใช้งานได้นั้นมักมีความซับซ้อนและรายละเอียดปลีกย่อยจำนวนมาก  จึงมีความจำเป็นในการนำแนวคิดเชิงคำนวณมาประยุกต์ในการออก
แบบอย่างเป็นระบบ  โดยใช้การแบ่งปัญหาใหญ่เป็นปัญหาย่อย  การพิจารณารูปแบบการคิดเชิงนามธรรม  และการออกแบบอัลกอริทึม 

                 ผลลัพธ์จากขั้นตอนนี้ คือ โครงร่างของแอปพลิเคชันที่ประกอบด้วยส่วนย่อยต่าง ๆ ที่มีการกำหนดหน้าที่และการทำงานชัดเจน  รวมถึงการเชื่อมโยงกันของส่วนย่อยให้เป็นระบบใหญ่   การออกแบบที่ดีนำมาซึ่งองค์ประกอบที่สามารถทดสอบความถูกต้องได้ง่ายและสะดวกต่อการปรับเปลี่ยนตามความต้องการของผู้ใช้ในภายหลัง